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NatGene：外顯子測序揭示綠膿桿菌感染易感性相關(guān)遺傳變異
發(fā)布時間： 2012-08-01 點擊次數(shù)： 1799次患有囊腫性纖維化的個體患者具有較高的綠膿桿菌感染風(fēng)險，而綠膿桿菌感染又與長期性肺部疾病加重和存活率降低有關(guān)。一期《自然—遺傳學(xué)》Nature Genetics上的一項報告解析出若干與綠膿桿菌感染癥的易感性有關(guān)的遺傳變異。
作為美國國立心肺血液研究所（NHLBI）的外顯子測序計劃（ESP）的一部分，此次研究對43名初步感染綠膿桿菌的患者以及48名從未感染過綠膿桿菌的年長患者進(jìn)行了外顯子測序。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，DCTN4中的數(shù)個變異與腫囊性纖維化患者體內(nèi)的綠膿桿菌的空氣傳染、慢性感染以及黏液型綠膿桿菌存在關(guān)聯(lián)。他們繼續(xù)對696名腫囊性纖維化患者進(jìn)行檢測，驗證了上述發(fā)現(xiàn)。
為了鑒定出影響綠膿桿菌感染風(fēng)險的宿主遺傳因子，Michael Bamshad、 Mary Emond等人使用了一種表現(xiàn)型研究設(shè)計方案，選擇那些處于表現(xiàn)型分布兩端的患者，并結(jié)合了外顯子測序手段。